\n 때문에 틀린걸까요? 어떤 테스트케이스에서 틀렸는지 잘 모르겠네요...

hasNextLine()은 마지막에 \n으로 끝나는 경우를 인식하지 못합니다. in.read() InputStreamReader hasNext() 등 다양한 방법이 있으니 한번 활용해보시길 바랍니다.