EOF 를 제대로 처리하지 못하고 있어서 WA가 뜨는건가요? 뭐 때문에 wa가 뜨는지 제대로 모르겠습니다.

딱 한줄만 입력받게 하고 있군요. 아래 처럼 해보는게 어때요? while (fgets(s1, 1000, stdin) != NULL) { ... }

아하.. 그 부분은 해결 된거 같은데, 이번엔 runtime error 가 괴롭히네요 ㅠㅠ... 이건 어느 부분에서 문제가 있다는 말인가요?